Spider-Man: Web of Shadows to gra akcji ukazana z perspektywy trzeciej osoby.
Fabuła programu jest niezależna od tej znanej z filmów z Człowiekiem-Pająkiem w roli głównej. Nowojorski Manhattan został opanowany przez niebezpieczne symbionty, które zmieniają ludzi i otoczenie. Zadaniem głównego bohatera jest uratowanie miasta. Spider-Mana wspiera organizacja S.H.I.E.L.D. oraz rozmaite postacie znane z komiksów i filmów.
Rozgrywka polega na kierowaniu postacią swobodnie przemieszczająca się po mieście i walczącą z napotkanymi przeciwnikami. Gracz może przy tym wpływać na zdolności głównego bohatera przez zmianę jego stroju (czerwony zwiększa zwinność, czarny zaś siłę).
W miarę postępów w rozgrywce postać stopniowo zwiększa swoje możliwości, między innymi ucząc się zadających dużo obrażeń kombinacji ciosów.
Grafika programu jest trójwymiarowa i dopracowana.